Das hört sich eher danach an, als ob die Hzg die Wärme nicht wegbekommt und runterfährt.
Doofe Frage (n): Die Ansaugung liegt nicht neben den Ausströmern, oder?
Hast du einen externen Temperatur-Sensor angeschlossen?
Der Querschnitt der Ansaugung ist über die gesamte Länge gleich?
Welche elektrischen Anschlüsse hast Du geändert?
Edit: Mir ist da gerade noch ein Satz aus der Einbauschulung eingefallen, wenn beim Umschalten von Frisch- auf Umluftbetrieb die Heizung ausgeht.
Es geht um die Teileleitzahl. Jedes Teil hat eine Teileleitzahl und verringert den Heizluftdurchsatz. Jedes Heizgerät hat eine Gerätezahl. Die Summe der einzelnen Teileleitzahlen darf nicht höher als die Gerätezahl sein.
Die Airtronic D4 mit Hutze 75 hat eine Gerätezahl von 3, die D4 Plus mit Hutze 75 bei Frischluftbetrieb 10, bei Umluft von 8.
Da ich Deinen Aufbau der Luftansaugung und -Verteilung nicht kenne, solltest Du selber mal nachrechnen.
Link Eberspächer.
Ab der Seite 37 ff wird es interessant.
Ab der Seite 44 ff findest Du die einzelnen Teileleitzahlen.